人物简介

张洪，中国科学技术大学管理学院统计与金融系教授。

张洪教授个人主页：http://staff.ustc.edu.cn/~zhangh/

学习经历

1993.9-1997.6，中国科大数学系计算数学及其应用软件专业，获理学学士学位。

1997.9-2000.6，中国科大数学系应用数学专业（导师：赵林城教授），获理学硕士学位。

2001.2-2003.12，中国科大统计与金融系概率论与数理统计专业（导师：应志良教授、赵林城教授），获理学博士学位。

工作经历

2000.7-2011，中国科大统计与金融系，助教/讲师。

2011.2-2018.5，复旦大学生物统计学研究所，研究员、博导。

2018.6至今，中国科大统计与金融系，教授、博导。

博士后研究

2004.3-2005.4，乔治华盛顿大学统计系（postdoctoral scientist）

2006.8-2007.11，耶鲁大学医学院（postdoctoral associate）

2009.1-2010.12，美国NIH国立癌症研究所（postdoctoral visiting fellow）

主要研究方向：统计计算、大数据分析、遗传统计。

研究成果

在Biometrika、Biometrics、Bioinformatics、Biostatistics、Annals of Applied Statistics、Statistics in Medicine、Statistica Sinica等国内外统计学期刊上发表论文50多篇，获得近600次引用（google scholar检索，其中大部分为他引），单篇引用次数超过50的论文有5篇；参与撰写的教材《遗传学中的统计方法》（科学出版社，2006年）被多所高校采用。

部分研究项目

1. 高通量生物医学数据的统计方法学研究，引进人才启动基金，100万，2018.6.1-2020.5.31，主持

2. 基于新一代高通量测序数据的若干统计方法学研究，国家自然科学基金面上项目，48万，2018.1.1-2021.12.31，主持

3. 基于新一代测序数据的统计遗传学新理论、方法与应用，973项目，约900万， 2012.1.1-2016.8.31，课题骨干（排名3/7）

4. 全基因组DNA甲基化研究中的统计学方法，国家自然科学基金面上项目， 50万，2014.1.1-2017.12.31，主持

5. 人类基因关联分析的若干问题，国家自然科学基金青年项目，15万，2008.1.1-2010.12.31，主持

研究生培养：截至到2017年已经培养了3名博士和2名硕士:

沈琦（博士），2011.9-2015.6，目前在纽约西奈山医院从事博士后研究。

胡继媛（博士），2011.9-2016.6，目前在纽约大学从事博士后研究。

王晨阳（博士），2012.9-2017.6，目前在燃石医学（上海）从事精准医学的研究工作。

康光梁（硕士），2013.9-2016.6，目前在阿里巴巴（杭州）从事大数据分析工作。

杜理（硕士），2014.9-2017.6，目前在中泰证券（上海）从事大数据分析工作。

研究生招生

欢迎对研究有热情、具有扎实数理基础的本科生报考本人的硕士/博士研究生。

博士后招收

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部分论文列表（共同第一作者*，通讯作者#）

1. Zhang H, Chatterjee N, Rader D, Chen J (2018). Adjustment of non-confounding covariates in case-control genetic associaiton studies. Annals of Applied Statistics 12(1):200-221.

2. Zhou B, Wen S, Wang L, Jin L, Li H, Zhang H# (2017). AntCaller: An accurate variant caller incorporating ancient DNA damage. Molecular Genetics and Genomics 292(6):1419-1430.

3. Wang C, Shen Q, Du L, Xu J, Zhang H# (2016). armDNA: A functional beta model for detecting age-related genomewide DNA methylation marks. Statistical Methods in Medical Research DOI: 10.1177/0962280216683571.

4. Kang G, Du L, Zhang H# (2016). multiDE: a dimension reduced model based statistical method for dierential expression analysis using RNA-sequencing data with multiple treatment conditions. BMC Bioinformatics 17: 248.

5. Shen Q, Hu J, Jiang N, Hu X, Luo Z, Zhang H# (2016). contamDE: Difierential expression analysis of RNA-seq data for contaminated tumor samples. Bioinformatics 32(5): 705-712.

6. Hu J, Li T, Xiu Z, Zhang H# (2015). MAFsnp: A Multi-sample Accurate and Flexible SNP Caller Using Next-generation Sequencing Data. PLoS ONE 10(8): e0135332. doi:10.1371/journal.pone.0135332.

7. Zhang H#, Xu J, Jiang N, Hu X, Luo Z (2015). PLNseq: a multivariate Poisson lognormal distribution for high-throughput matched RNA-sequencing read count data. Statistics in Medicine 34: 1577-1589.

8. Zhang H, Qin J, Landi M, Caporaso N, Yu K (2013). A copula-model based semiparametric interaction test under the case-control design. Statistica Sinica. 23: 1505-1521.

9. Zhang H, Zeng D, Olschwang S, Yu K (2013). Semiparametric inference on the penetrances of rare genetic mutations based on a case-family design. Journal of Statistical Planning and Inference. 143: 368-377.

10. Zhang H, Wacholder S, Qin J, Hildesheim A, Yu K (2011). Improved genetic association tests for an ordinal outcome representing the disease progression process. Genetic Epidemiology. 35:499-505.

11. Zhang H, Ahn J, Yu K (2011). Comparing statistical methods for removing seasonal variation from vitamin D measurements in case-control studies. Statistics and Its Interface. 4:85-93.

12. Li T, Li Z, Ying Z, Zhang H#. (2010). Influence of population stratification on population based marker-disease association analysis. Annals of Human Genetics. 74:351-360.

13. Zhang H, Olschwang S, Yu K. (2010). Statistical inference on the penetrances of rare genetic mutations based on a case-family design. Biostatistics. 11:519-532.

14. Wu C*, Zhang H*, Liu X, DeWan A, Dubrow R, Ying Z, Yang Y, Hoh J (2009). Detecting essential and removable interactions in genome-wide association studies. Statistics and Its Interface. 2:161-170.

15. Zhang H, Chen H, Li Z. (2009). Large sample interval mapping method for genetic trait loci infinite regression mixture models. Journal of Statistical Planning and Inference. 139:764-779.

16. Yan T, Yang Y, Cheng X, DeAngelis MM, Hoh J, Zhang H# (2009). Genotypic association analysis using discordant-relative-pairs. Annals of Human Genetics. 73:84-94.

17. Francis P*, Zhang H*, DeWan A, Hoh J, Klein M (2008). Joint eects of polymorphisms in the HTRA1, LOC387715/ARMS2, and CFH genes on AMD in a Caucasian population. Molecular Vision. 14:1395-1400.

18. Zhang H, Morrison MA, DeWan A, Adams S, Andreoli M, Huynh N, Regan M, Brown A, Miller JW, Kim IK, Hoh J, DeAngelis MM (2008). The NEI/NCBI dbGAP database: Genotypes and haplotypes that may specifically predispose to risk of neovascular age-related macular degeneration. BMC Medical Genetics. 9:51.

19. Chen K*, Ying Z*, Zhang H*, Zhao L* (2008). Analysis of least absolute deviation. Biometrika. 95(1):107-122.

20. Zhang H, Chen H, Li Z. (2008). An explicit representation of the limit of the LRT for interval mapping of quantitative trait loci. Statistics and Probability Letters. 78:207-213.

21 Zhang Han, Zhang Hong#, Li Zhaohai, Zheng Gang (2007). Statistical methods for haplotype-based matched case-control association studies. Genetic Epidemiology. 31(4):316-326.

22. Zhang H, Zheng G, Li Z (2006). Statistical analysis for haplotype-based matched case-control studies. Biometrics, 62:1124-1131.